- Ο αρμόδιος υπόλογος διαχειριστής έργου μεριμνά, ώστε οι δαπάνες για την εκτέλεση της πληρωμής να συμμορφώνονται με τον προϋπολογισμό του ενταγμένου έργου, καθώς και με τις αρχές της χρηστής δημοσιονομικής διαχείρισης.
- Ο αρμόδιος υπόλογος διαχειριστής έχει την ευθύνη εκκαθάρισης της δαπάνης. Στο πλαίσιο της πράξης αυτής, ελέγχει τα δικαιολογητικά έγγραφα που πιστοποιούν τα δικαιώματα του δικαιούχου πληρωμής, σύμφωνα με τους όρους που προβλέπονται στη νομική δέσμευση, καθώς και τη νομιμότητα και κανονικότητα της δαπάνης.
- Προκειμένου να καταβληθεί η δαπάνη, εκδίδεται εντολή πληρωμής στη βάση της οποίας εκτελούνται ηλεκτρονικές πληρωμές.
- Η διαδικασία εκκαθάρισης, έκδοσης εντολής πληρωμής και εκτέλεσης των ηλεκτρονικών πληρωμών πραγματοποιούνται μέσω του e-ΠΔΕ, σύμφωνα με το άρθρο 38.
- H έκδοση των Συμψηφιστικών Χρηματικών Ενταλμάτων πληρωμών ΑΠΔΕ διενεργείται μέσω του Ολοκληρωμένου Πληροφοριακού Συστήματος Δημοσιονομικής Πολιτικής από τις αρμόδιες οικονομικές υπηρεσίες των φορέων χρηματοδότησης της Κεντρικής Διοίκησης.