Για την εκτέλεση του έργου και τη λειτουργία του Εθνικού Μηχανισμού Πρόληψης, προβλέπεται η εγγραφή κατ΄έτος πιστώσεων από τον Κρατικό Προϋπολογισμό στον Προϋπολογισμό της Ανεξάρτητης Αρχής «Συνήγορος του Πολίτη» σε ειδικό ΚΑΕ, σύμφωνα με τα προβλεπόμενα στις διατάξεις της παραγράφου 3 του ΄Αρθρου 18 του ΄Αρθρου Πρώτου του παρόντος νόμου, έπειτα από πρόταση του Συνηγόρου του Πολίτη ο οποίος είναι και διατάκτης των δαπανών του Εθνικού Μηχανισμού Πρόληψης, που διατίθενται αποκλειστικά για τους σκοπούς αυτούς.