1. Οι συνεδριάσεις των Ανεξάρτητων Διοικητικών Επιτροπών δεν είναι δημόσιες. Κατά τη συζήτηση της υποθέσεως, ο προσφεύγων μπορεί να παρίσταται αυτοπροσώπως ή με δικηγόρο και το Δημόσιο, εφόσον παρίσταται, εκπροσωπείται από τον Υπουργό Οικονομικών, ειδικώς δε επί φορολογικών και τελωνειακών διαφορών από την αρχή που εξέδωσε τη σχετική (αρχική) πράξη ή που παρά το νόμο παρέλειψε την έκδοσή της, ενώ τα νομικά πρόσωπα δημοσίου και ιδιωτικού δικαίου, εφόσον παρίστανται, εκπροσωπούνται από τους νομίμους εκπροσώπους τους.
Οι παραπάνω μπορούν να υποβάλλουν υπομνήματα.
Σε κάθε περίπτωση η συζήτηση χωρεί και χωρίς την παρουσία των μερών.
2. Η Ανεξάρτητη Διοικητική Επιτροπή αποφαίνεται με αιτιολογημένη απόφασή της, μετά από εισήγηση ενός μέλους της, εντός προθεσμίας τριών (3) μηνών από την ημερομηνία ασκήσεως της ενδικοφανούς προσφυγής˙ υποχρεούται δε να επιλύει οριστικά, κατά το νόμο και την ουσία, τη διαφορά που άγεται, κάθε φορά, ενώπιόν της. Οι ορισθέντες ως εισηγητές, οφείλουν να προσκομίζουν στον πρόεδρο της Επιτροπής, το σχέδιο απόφασης επί της ενδικοφανούς προσφυγής, σε ηλεκτρονική μορφή το αργότερο, μέχρι το δεύτερο δεκαήμερο του τρίτου μήνα από την άσκηση αυτής.
3. Ο Πρόεδρος της Επιτροπής μπορεί, αν το κρίνει σκόπιμο, να καλεί, έξι (6) τουλάχιστον ημέρες πριν τη συζήτηση, τρίτο ο οποίος έχει έννομο συμφέρον να παρίσταται κατά τη συζήτηση. Δύναται, επίσης, να απορρίπτει, με συνοπτικά αιτιολογημένη απόφασή του, ενδικοφανείς προσφυγές που είναι προφανώς αβάσιμες ή απαράδεκτες.
4. Οι Επιτροπές ερευνούν ελευθέρως τα πραγματικά και νομικά ζητήματα των υποθέσεων. Μπορούν να καλούν οποιονδήποτε για να τους παρέχει πληροφορίες, να ενεργούν αυτοψία, να ζητούν τη διενέργεια πραγματογνωμοσύνης ή πρόσθετων επαληθεύσεων και ελέγχων καθώς και την προσκομιδή οποιουδήποτε εγγράφου και να προκαλούν γνωμοδοτήσεις ή γνωματεύσεις αρμοδίων οργάνων.
5. Η διακίνηση του όγκου των εγγραφών κάθε Περιφερειακού Γραφείου Ενδικοφανών Προσφυγών, γίνεται με ηλεκτρονικό τρόπο, όπως και η παρακολούθηση και η αρχειοθέτηση των υποθέσεων, κατά κατηγορία.
6. Οι πρόεδροι και τα μέλη των Ανεξάρτητων Διοικητικών Επιτροπών του ίδιου και των άλλων Περιφερειακών Γραφείων, ανταλλάσουν πληροφορίες για την ενότητα της αντιμετώπισης των ομοειδών υποθέσεων.
7. Είναι απαράδεκτη η άσκηση οποιασδήποτε άλλης διοικητικής προσφυγής, κατά των υποκειμένων στην ενδικοφανή προσφυγή, κατά τη διαδικασία του παρόντος νόμου, πράξεων ή παραλείψεων.
8. Μετά την έκδοση της αποφάσεως, ο φάκελος επιστρέφει στην αρχή, από πράξη ή παράλειψη της οποίας δημιουργήθηκε, για πρώτη φορά, η διαφορά. Η αρχή αυτή μεριμνά για την επίδοση της αποφάσεως στους ενδιαφερόμενους καθώς και για την άμεση εκτέλεσή της.
9. Οι αποφάσεις των Ανεξάρτητων Διοικητικών Επιτροπών, δεν υπόκεινται σε οποιαδήποτε διοικητική προσφυγή, ασκούμενη από οποιονδήποτε, είτε αυτός είναι άμεσα ενδιαφερόμενος είτε τρίτος. Οι αποφάσεις αυτές υπόκεινται στα κατά νόμο ένδικα βοηθήματα, η εκδίκαση των οποίων ανήκει σε πρώτο και τελευταίο βαθμό στο τριμελές διοικητικό πρωτοδικείο.
Κατ΄ εξαίρεση η εκδίκαση:
α) των φορολογικών και τελωνειακών εν γένει διαφορών, των οποίων το αντικείμενο δεν υπερβαίνει το ποσό των σαράντα χιλιάδων (40.000) ευρώ, ανήκει σε πρώτο και τελευταίο βαθμό στο μονομελές διοικητικό πρωτοδικείο. Εάν το αντικείμενο υπερβαίνει το ποσό των σαράντα χιλιάδων (40.000), αλλά υπολείπεται του ποσού των εκατόν πενήντα χιλιάδων (150.000) ανήκει σε πρώτο και τελευταίο βαθμό στο τριμελές διοικητικό πρωτοδικείο. Εάν το αντικείμενο υπερβαίνει το ποσό των εκατόν πενήντα χιλιάδων (150.000) ευρώ, ανήκει σε πρώτο και τελευταίο βαθμό στο τριμελές διοικητικό εφετείο.
β) των διαφορών που προκύπτουν από την εφαρμογή του άρθρου 13 του ν. 2523/1997 (Α΄ 179) και των περιπτώσεων γ΄, δ΄ και ε΄ της παραγράφου 4 του άρθρου 1 του ν. 1406/1983 (Α΄ 182), όπως ισχύουν, ανήκει στον πρόεδρο πρωτοδικών του διοικητικού πρωτοδικείου ο οποίος αποφαίνεται ανεκκλήτως. Για την εκδίκαση των προσφυγών αυτών, εφαρμόζονται οι διατάξεις της παραγράφου 9 του άρθρου 13 του ν. 2523/1997, όπως ισχύουν.
10. Οι λόγοι που περιέχονται στο ένδικο βοήθημα που ασκείται κατά των πράξεων της Επιτροπής, δεν επιτρέπεται, με ποινή το απαράδεκτο, να είναι διαφορετικοί από τις αιτιάσεις της ενδικοφανούς προσφυγής, εκτός αν αναφέρονται σε αυτοτελείς πλημμέλειες της απόφασης της Επιτροπής.
11. Αν την προσβληθείσα, με την ενδικοφανή προσφυγή, πράξη, έχει εκδώσει κρατική αρχή, το Δημόσιο, με το ένδικο βοήθημα, κατά της αποφάσεως της Επιτροπής, μπορεί να προβάλλει μόνο λόγους παράβασης νόμου ή πλάνης περί τα πράγματα.