Παρά την όποια αμφισβήτηση μπορεί να έχει κανείς σχετικά με το υφιστάμενο σύστημα σχεδιασμού, προκηρύξεων, αξιολόγησης και χρηματοδότησης προγραμμάτων, η δημιουργία παράλληλου σχήματος με αρμοδιότητα ανάλογες αποφάσεις στο πλαίσιο ενός ΝΠΙΔ και των αντίστοιχων προτεινόμενων οργάνων εμπεριέχει ένα σοβαρό πρόβλημα σύγκρουσης συμφερόντων. Ειδικά, στην μικρή αναλογικά ελληνική επιστημονική κοινότητα δε μπορεί να υποστηριχθεί εύκολα η ανεξαρτησία ενός επιστήμονα, π.χ. από το Πανεπιστήμιο ή το Ερευνητικό Κέντρο που ανήκει.
Επίσης, το ενδεχόμενο να αποφασίζουν επιστήμονες για το σχεδιασμό και τις διαδικασίες αξιολόγησης και χρηματοδότησης έρχεται σε αντίθεση με τη λειτουργία του ΕΣΕΚ και άλλων επιστημονικών συμβουλίων τα οποία έχουν συμβουλευτικό / γνωμοδοτικό ρόλο με τον οποίο και συμφωνούμε.
Τέλος, να σημειώσω ότι ανάλογη προσπάθεια λήψης αποφάσεων για ερευνητικά προγράμματα από επιστήμονες παρατηρήθηκε και στη νομοθετική δημιουργία ανάλογου ΝΠΙΔ στο παρελθόν (ΕΟΕΤ) στον αλήστου μνήμης ανεφάρμοστο Νόμο 3653 του 2008.
Παρά την όποια αμφισβήτηση μπορεί να έχει κανείς σχετικά με το υφιστάμενο σύστημα σχεδιασμού, προκηρύξεων, αξιολόγησης και χρηματοδότησης προγραμμάτων, η δημιουργία παράλληλου σχήματος με αρμοδιότητα ανάλογες αποφάσεις στο πλαίσιο ενός ΝΠΙΔ και των αντίστοιχων προτεινόμενων οργάνων εμπεριέχει ένα σοβαρό πρόβλημα σύγκρουσης συμφερόντων. Ειδικά, στην μικρή αναλογικά ελληνική επιστημονική κοινότητα δε μπορεί να υποστηριχθεί εύκολα η ανεξαρτησία ενός επιστήμονα, π.χ. από το Πανεπιστήμιο ή το Ερευνητικό Κέντρο που ανήκει. Επίσης, το ενδεχόμενο να αποφασίζουν επιστήμονες για το σχεδιασμό και τις διαδικασίες αξιολόγησης και χρηματοδότησης έρχεται σε αντίθεση με τη λειτουργία του ΕΣΕΚ και άλλων επιστημονικών συμβουλίων τα οποία έχουν συμβουλευτικό / γνωμοδοτικό ρόλο με τον οποίο και συμφωνούμε. Τέλος, να σημειώσω ότι ανάλογη προσπάθεια λήψης αποφάσεων για ερευνητικά προγράμματα από επιστήμονες παρατηρήθηκε και στη νομοθετική δημιουργία ανάλογου ΝΠΙΔ στο παρελθόν (ΕΟΕΤ) στον αλήστου μνήμης ανεφάρμοστο Νόμο 3653 του 2008.