Με την έναρξη ισχύος του παρόντος νόμου, τα Ερευνητικά Κέντρα και Τεχνολογικοί Φορείς που αναφέρονται ακολούθως (όπως μέχρι την έναρξη ισχύος του παρόντος είχαν συσταθεί και λειτουργούσαν), διατηρούνται, εποπτευόμενα από τον ΥΠΑΙΘ:
Α. Ερευνητικά Κέντρα
1. «Αθηνά – Ερευνητικό Κέντρο Καινοτομίας στις Τεχνολογίες της Πληροφορίας, των Επικοινωνιών και της Γνώσης»: (ΝΠΙΔ, σύμφωνα με το ν. 2919/2001, όπως έχει τροποποιηθεί από το Ν.3438/2006) το οποίο αποτελείται σύμφωνα με το με το Π.Δ. 145/20-05-2003 και το ν. 4051/2012) από τα εξής Ινστιτούτα.
1.1. Βιομηχανικών Συστημάτων / ΙΝΒΙΣ,
1.2. Επεξεργασίας του Λόγου / ΙΕΛ,
1.3. Πληροφοριακών Συστημάτων / ΙΠΣΥ.
2. Εθνικό Αστεροσκοπείο Αθηνών / ΕΑΑ: (ΝΠΔΔ, Ιδρυθέν το 1842 με δωρεά του Γεώργιου Σίνα, διέπεται από το ν. 1975/1942, όπως τροποποιήθηκε από το ν.δ 3402/1955 και το ν. 1349/1983, λειτουργεί με το ΠΔ. 62 ΦΕΚ Α΄ 21/10.03.1986), εποπτεύεται από τον ΥΠΑΙΘ και αποτελείται, σύμφωνα με το άρθρο 5 Ν.4051/2012,ΦΕΚ Α 40/29.2.2012) από τα εξής Ινστιτούτα:
2.1. Γεωδυναμικό Ινστιτούτο / ΓΙ. (Σύμφωνα με το 62 ΦΕΚ Α΄ 21/10.03.1986),
2.2. Ινστιτούτο Αστρονομίας, Αστροφυσικής, Διαστημικών Εφαρμογών και Τηλεσκόπησης / ΙΑΑΔΕΤ,
2.3. Ινστιτούτο Ερευνών Περιβάλλοντος και Βιώσιμης Ανάπτυξης / ΙΕΠΒΑ (Σύμφωνα με το 62 ΦΕΚ Α΄ 21/10.03.1986).
3. Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών / Ε.Ι.Ε.: (ΝΠΙΔ σύμφωνα με το ΠΔ 226/1989), το οποίο αποτελείται, σύμφωνα με το άρθρο 5 Ν.4051/2012,ΦΕΚ Α 40/29.2.2012) τα εξής Ινστιτούτα
3.1. Ινστιτούτο Βιολογίας, Φαρμακευτικής Χημείας και Βιοτεχνολογίας / ΙΒΦΧΒ (Σύμφωνα με το ΠΔ 226/1989 και το άρθρο 5 Ν.4051/2012),
3.2. Ινστιτούτο Θεωρητικής και Φυσικής Χημείας / ΙΘΦΧ (Σύμφωνα με το ΠΔ 226/1989 και το άρθρο 5 Ν.4051/2012),
3.3. Ινστιτούτο Ιστορικών Ερευνών / ΙΙΕ. (Σύμφωνα με το ΠΔ 226/1989 και το άρθρο 5 Ν.4051/2012),
3.4. Εθνικό Κέντρο Τεκμηρίωσης και Ηλεκτρονικού Περιεχομένου / ΕΚΤ (Υπηρεσία του ΕΙΕ, διατηρούμενη, με το ν. 3197/2003, ως επιστημονική εγκατάσταση του ΕΙΕ, χρηματοδοτούμενη αυτοτελώς από τον τακτικό προϋπολογισμό της ΓΓΕΤΚ.
4. Εθνικό Κέντρο Έρευνας και Τεχνολογικής Ανάπτυξης / ΕΚΕΤΑ: (ΝΠΙΔ σύμφωνα με το ΠΔ. 77/2000 (Α ́ 65), το οποίο αποτελείται, σύμφωνα με το άρθρο 5 Ν.4051/2012,ΦΕΚ Α 40/29.2.2012) τα εξής Ινστιτούτα:
4.1. Ινστιτούτο Έρευνας, Τεχνολογίας και Ανάπτυξης Θεσσαλίας / ΚΕΤΕΑΘ. (Σύμφωνα με το ν.4109/2013 και το ΠΔ 77/2000).
4.2. Ινστιτούτο Τεχνολογίας και Εφαρμογών Στερεών Καυσίμων (ΚΤΕΣΚ), σύμφωνα με το Π.Δ. 374/1987 (ΦΕΚ Α’ 167), το ΠΔ 82/2002 ΦΕΚ Α’ 59 και το Π.Δ. 77/2000 (ΦΕΚ Α’ 65).
4.3. Ινστιτούτο Βιώσιμης Κινητικότητας και Δικτύων Μεταφορών / ΙΜΕΤ (Σύμφωνα με το ν. 4051/2012 και το ΠΔ 77/2000).
4.4. Ινστιτούτο Εφαρμοσμένων Βιοεπιστημών / ΙΝΕΒ. (Σύμφωνα με το ν. 4051/2012 και το ΠΔ 77/2000).
4.5. Ινστιτούτο Τεχνολογιών Πληροφορικής και Επικοινωνιών / ΙΠΤΗΛ (Σύμφωνα με το ν. 4051/2012 και το ΠΔ 77/2000).
4.6. Ινστιτούτο Χημικών Διεργασιών και Ενεργειακών Πόρων / ΙΔΕΠ (Σύμφωνα με το ΠΔ 161/2001, το ν. 4051/2012 και το ΠΔ 77/2000).
5. Εθνικό Κέντρο ‘Έρευνας Φυσικών Επιστημών «ΔΗΜΟΚΡΙΤΟΣ»: (ΝΠΔΔ, σύμφωνα με το άρθρο 28 παρ. 1 του Ν. 1514/1985 (Α΄ 13) που αποτελείται σύμφωνα με το ν. 4051/2012 από τα εξής Ινστιτούτα:
5.1. Βιοεπιστημών και Εφαρμογών / ΙΒΕ,.
5.2. Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών / ΙΠΤ,
5.3. Προηγμένων Υλικών, Φυσικοχημικών Διεργασιών, Νανοτεχνολογίας και Μικροσυστημάτων.
5.4. Πυρηνικής και Σωματιδιακής Φυσικής,
5.5. Πυρηνικών και Ραδιολογικών Επιστήμων, Ενεργείας, Τεχνολογίας και Ασφάλειας,
6. Εθνικό Κέντρο Κοινωνικών Ερευνών / ΕΚΚΕ: (ΝΠΔΔ, σύμφωνα με το Ν.Δ. 3998/1959, τα ΒΔ 502/1968 (Α΄168), 539/1968 (Α΄ 203) και το ν. 4051/2012), το οποίο αποτελείται σύμφωνα με το ν. 4051/2012 από το Ινστιτούτο Κοινωνικών Ερευνών,
7. Ελληνικό Ινστιτούτο PASTEUR / ΕΙΠ: (ΝΠΙΔ, μέλος του διεθνούς δικτύου ινστιτούτων PASTEUR, λειτουργούν δυνάμει του νόμου 3733/2009 ΦΕΚ Α΄ 7/28.1.2009) που κύρωσε την από 28.3.2008 διμερή συμφωνία Ελλάδας – Γαλλίας),
8. Ελληνικό Κέντρο Θαλασσίων Ερευνών / ΕΛΚΕΘΕ: (ΝΠΔΔ σύμφωνα με το ν. 2919/2001 και το ΠΔ 164/2003, ΦΕΚ Α΄ 131/03.06.2003), το οποίο αποτελείται από τα εξής Ινστιτούτα:
8.1. Ινστιτούτο Θαλάσσιας Βιολογίας Βιοτεχνολογίας και Υδατοκαλλιεργειών (σύμφωνα με το ν. 2919/2001, ΠΔ 164/2003, ΦΕΚ Α΄ 131/03.06.2003 και το ν. Ν.4051/2012),
8.2. Ινστιτούτο Θαλάσσιων Βιολογικών Πόρων και Εσωτερικών Υδάτων Ινστιτούτο Ωκεανογραφίας (σύμφωνα με το ν. 2919/2001, ΠΔ 164/2003, ΦΕΚ Α΄ 131/03.06.2003 και το ν. Ν.4051/2012),
8.3. Ινστιτούτο Ωκεανογραφίας, (σύμφωνα με το ΠΔ 164/2003, ΦΕΚ Α΄ 131/03.06.2003 και το ν. 4051/2012),
9. Ερευνητικό Κέντρο Βιοϊατρικών Επιστημών «Αλέξανδρος Φλέμινγκ» / ΕΚΕΒΕ. Α. Φλέμινγκ (ΝΠΙΔ, σύμφωνα με το Π.Δ. 93/1995 (Α΄ 57), όπως τροποποιήθηκε με τα ΠΔ 362/1995 (Α΄193) και 198/1997 (Α΄156),
9.1. Ινστιτούτο Βιοϊατρικών Επιστημών «Αλέξανδρος Φλέμινγκ» (σύμφωνα με το Άρθρο 5 του ν. 4051/2012),
10. Ίδρυμα Τεχνολογίας και Έρευνας / Ι.Τ. Ε.: (ΝΠΙΔ, σύμφωνα με το ΠΔ 432/1987) και αποτελείται σύμφωνα με το ν. 4051/2012 από τα εξής Ινστιτούτα:
10.1. Μοριακής Βιολογίας και Βιοτεχνολογίας / ΙΜΒΒ,
10.2. Επιστημών Χημικής Μηχανικής / IEXM,
10.3. Ηλεκτρονικής Δομής και Λέιζερ / ΙΗΔΛ,
10.4. Μεσογειακών Σπουδών / ΙΜΣ,
10.5. Ινστιτούτο Πληροφορικής / ΙΠ,
10.6. Υπολογιστικών Μαθηματικών / ΙΥΜ.
Β. Τεχνολογικοί Φορείς
1. Εθνικό Δίκτυο Έρευνας και Τεχνολογίας Α.Ε. / Ε.Δ.Ε.Τ. Α.Ε.
2. Ελληνική Επιτροπή Ατομικής Ενέργειας / Ε.Ε.Α.Ε.