Η Διεύθυνση Διοικητικής και Οικονομικής Διαχείρισης έχει τους έξης υπηρεσιακούς στόχους:
α) τον συντονισμό εφαρμογής των πολιτικών, συστημάτων και διαδικασιών που αποσκοπούν στην ορθολογική διοίκηση και διαχείριση του ανθρώπινου δυναμικού του Νομικού Προσώπου,
β) την παροχή γενικών υπηρεσιών διοικητικής υποστήριξης προς το Διοικητικό Συμβούλιο και τις υπηρεσίες,
γ) την αποτελεσματική τήρηση των οικονομικών προγραμμάτων λειτουργίας του Νομικού Προσώπου,
δ) τη σωστή απεικόνιση των οικονομικών πράξεων και τη διαχείριση των εσόδων και δαπανών του,
ε) τη διασφάλιση και αξιοποίηση της περιουσίας του,
στ) την αποτελεσματική διενέργεια όλων των νόμιμων διαδικασιών που απαιτούνται για την προμήθεια υλικών, εξοπλισμού και υπηρεσιών του Νομικού Προσώπου,
ζ) τη συντήρηση και τη διατήρηση σε καλή κατάσταση των κάθε είδους κτιριακών και ηλεκτρομηχανολογικών εγκαταστάσεων του Νομικού Προσώπου,
η) την συμμετοχή στη σύνταξη της ετήσιας έκθεσης πεπραγμένων και προτάσεων για την βελτίωση του νομοθετικού και κανονιστικού πλαισίου λειτουργίας που υποβάλλει το Διοικητικό Συμβούλιο στους Υπουργούς Παιδείας, Έρευνας και Θρησκευμάτων, Οικονομικών και Διοικητικής Ανασυγκρότησης.