Η Ακαδημία εδρεύει στην Αθήνα, στο Μέγαρο επί της οδού Πανεπιστημίου 28, το οποίο ανεγέρθηκε με δαπάνες των αειμνήστων Σίμωνος και Ιφιγένειας Σίνα, προς αποκλειστική χρήση από αυτήν. Το κτίριο αυτό με τους κήπους του και τον περιβάλλοντα χώρο, που ορίζεται από τις οδούς Πανεπιστημίου, Σίνα, Ακαδημίας και Πατριάρχου Γρηγορίου Ε΄ και έχει κηρυχθεί ιστορικό διατηρητέο μνημείο, ανήκει κατά πλήρες δικαίωμα κυριότητας στην Ακαδημία και χρησιμοποιείται από αυτή, προς εκπλήρωση των σκοπών της.