Με απόφαση του Υπουργού Αγροτικής Ανάπτυξης & Τροφίμων και τυχόν άλλου καθ’ ύλην αρμόδιου Υπουργού δύναται να ορίζονται Ενδιάμεσοι Φορείς Διαχείρισης οι οποίοι αναλαμβάνουν την άσκηση αρμοδιοτήτων διαχείρισης μέρους του ΠΑΑ και πληρούν τις προϋποθέσεις του άρθρου 66 παρ. 2 του Κανονισμού Αγροτικής Ανάπτυξης. Με όμοια απόφαση δύναται να ορίζονται ενδιάμεσοι φορείς διαχείρισης στο πλαίσιο του ΕΠΑλΘ.
Οι προτεραιότητες του ΠΑΑ που υλοποιούνται από Ομάδες Τοπικής Δράσης, εφεξής «ΟΤΔ» και πληρούν τους όρους έτσι όπως περιγράφονται στα άρθρα 42 του κανονισμού 1305/2013 και άρθρο 34 του κανονισμού 1303/2013).