Στο δεύτερο εδάφιο του άρθρου 85 του ν. 2776/1999 (Α΄291) επικαιροποιείται η παραπομπή στον Κώδικα Ποινικής Δικονομίας και το άρθρο 85 διαμορφώνεται ως εξής:
«Άρθρο 85
Αρμοδιότητες του Δικαστικού Λειτουργού
Ο αρμόδιος δικαστικός λειτουργός έχει τα προβλεπόμενα από την κείμενη νομοθεσία καθήκοντα. Ειδικότερα, αποφασίζει επί όσων θεμάτων του ανατίθενται στον παρόντα Κώδικα, ασκεί τις αρμοδιότητες του άρθρου 567 Κώδικα Ποινικής Δικονομίας συμμετέχει στη σύνθεση του Δικαστηρίου Εκτέλεσης Ποινών και δικαιούται να ασκεί προσφυγή κατ` αποφάσεων του Συμβουλίου Φυλακής, εξαιρούμενος στην περίπτωση αυτήν από τη σύνθεση του πιο κάτω Δικαστηρίου κατά την εκδίκαση της προσφυγής του.».