Η Γενική Συνέλευση του Φαρμακευτικού Συλλόγου είναι αρμόδια για:
α) Τη συζήτηση και τη λήψη απόφασης για κάθε ζήτημα που αφορά στον Φαρμακευτικό Σύλλογο και εμπίπτει στους σκοπούς του, εκτός από εκείνα που έχουν ανατεθεί στην αρμοδιότητα άλλου οργάνου,
β) την εκλογή των μελών του Διοικητικού Συμβουλίου και τον έλεγχο των πεπραγμένων του,
γ) την ψήφιση του ετήσιου προϋπολογισμού των εσόδων και τον εξόδων που υποβάλλεται από το Διοικητικό Συμβούλιο, τον έλεγχο της διαχείρισης και την έγκριση του απολογισμού.